2002年9月2日安徽省阜阳市水利规划设计院正式成立，注册资本300万。
2021年3月17日，安徽省阜阳市水利规划设计院因改制正式更名为“安徽省阜阳市水利规划设计院有限公司”，注册资本3000万元。设计资质为水利行业（河道整治）专业甲级，水利行业（水库枢纽、引调水、灌溉排涝、城市防洪、围垦）专业乙级，水资源论证乙级；监理资质为水利工程施工监理甲级；水土保持施工监理丙级；水利工程建设环境保护资质。现有职工86人，正高级工程师2人，高级工程师42人，工程师30人。安徽省阜阳市水利规划设计院有限公司下设办公室、总工室、规划室、水工室、建筑室、综合室、咨询部和监理部。
